XNATの実践デモ: 画像情報学ソフトウェアプラットフォーム

目次

1. Xナットの始め方
2. Xナットのユーザーインターフェースの使い方
3. プロジェクトの作成
4. 画像のアップロードと表示
5. プラグインの使用方法
6. データの注釈付けと計測
7. プロジェクトの共有
8. データのダウンロードと保存
9. 管理者としての機能の活用
10. 既存のリポジトリからのデータ移行のヒントと注意事項

Xナットの始め方

Xナットは、画像の保存と共有を容易にするプラットフォームです。ここでは、Xナットの始め方について説明します。

まず、Googleで「Ubi Xナット」を検索し、最初のリンクをクリックします。そして、HPC for AIにホストされたXナットのインスタンスにアクセスします。ゲストとしてログインすると、ホーム画面が表示されます。ここからプロジェクトを作成し、データをアップロードできます。

Xナットのユーザーインターフェースの使い方

Xナットのユーザーインターフェースは非常に使いやすく、機能も豊富です。まず、ホーム画面で検索機能を使用してプロジェクトを検索できます。プロジェクトを開くと、その詳細情報やサブジェクト、実験、スキャンなどのデータが表示されます。

また、OHFビューアーを使用して画像を表示することもできます。OHFビューアーは、医療画像ビューアーと同様の機能を提供します。ズーム、パン、コントラスト調整などの操作が可能です。

プロジェクトの作成

新しいプロジェクトを作成するには、メタデータ情報を入力する必要があります。プロジェクトのタイトル、説明、キーワードを入力し、関連する研究者を追加することもできます。プロジェクトのアクセシビリティも設定できます。アクセシビリティのオプションには、プライベート、保護、パブリックなどがあります。プロジェクトが作成されると、アクセスタブから他のユーザーを追加することができます。

画像のアップロードと表示

Xナットでは、画像データのアップロードと表示も簡単です。プロジェクト内には様々なアップロードオプションがあります。また、OHFビューアーを使用して画像を表示することもできます。ビューアーには、ズーム、パン、コントラストの調整などの機能があります。

プラグインの使用方法

Xナットにはさまざまなプラグインがあり、これらを使用することで機能を拡張することができます。プラグインの追加は管理者に依頼する必要があります。追加されたプラグインは、ツールメニューからアクセスできます。

データの注釈付けと計測

Xナットでは、画像データに対して注釈付けや計測を行うことができます。注釈付けをするためには、コンターやマスクなどの領域を選択し、描画します。さらに、長さや角度などの計測も行うことができます。これらの注釈や計測結果は保存され、後で確認することができます。

プロジェクトの共有

Xナットでは、プロジェクトの共有が容易に行えます。他のユーザーをコラボレーターとして追加することで、プロジェクトを共有することができます。また、データのダウンロードや共有も簡単に行えます。

データのダウンロードと保存

Xナットでは、データのダウンロードと保存も簡単です。プロジェクト内のデータを選択し、ダウンロードのオプションを選択することで、データをダウンロードすることができます。また、データをローカルに保存することも可能です。

管理者としての機能の活用

管理者はさまざまな機能を活用することができます。ユーザーの管理やプラグインの追加など、さまざまな作業を行うことができます。管理者としての機能については、別途ミーティングやウェビナーにて詳しく説明することも可能です。

既存のリポジトリからのデータ移行のヒントと注意事項

既存のリポジトリからXナットにデータを移行する場合、いくつかのヒントと注意事項があります。大量のデータをアップロードする場合は、デスクトップクライアントを使用するか、一括アップロード機能を活用することをおすすめします。

アップロードするデータがDICOM形式であれば、特に問題はありません。ただし、大容量のファイルをアップロードする際には注意が必要です。また、データ移行の際には、データの整理や変換などが必要になる場合もあります。

以上がXナットの利用方法についての概要です。もし何か質問があれば、お気軽にお知らせください。

強み

• 画像データの保存と共有が容易
• インターフェースが使いやすい
• プラグインの追加による機能の拡張が可能
• データの注釈付けと計測が簡単に行える
• プロジェクトの共有とデータのダウンロードが便利
• 管理者としての機能を活用できる

まとめ

Xナットは、画像の保存と共有を容易にするプラットフォームです。ユーザーは画像データをアップロードし、注釈付けや計測を行うことができます。また、プロジェクトの共有やデータのダウンロードも簡単に行えます。さらに、管理者としての機能を活用することも可能です。

FAQ:

Q: Xナットのインスタンスにアクセスする方法はありますか？ A: Xナットのインスタンスにアクセスするには、Googleで「Ubi Xナット」を検索し、最初のリンクをクリックします。そこからログインすることができます。

Q: プロジェクトの作成方法について教えてください。 A: プロジェクトを作成するには、メタデータ情報を入力し、必要な設定を行います。詳細な手順は本文をご覧ください。

Q: データのダウンロード方法を教えてください。 A: ダウンロード方法には複数のオプションがあります。詳細な手順は本文をご覧ください。

Q: Xナットの管理者としての機能について教えてください。 A: 管理者はユーザーの管理やプラグインの追加など、さまざまな機能を活用することができます。詳細な説明については、本文をご覧ください。

リソース:

• Ubi Xナット